战神4故事承接战神3，战神3结尾奎托斯不顾雅典娜的劝阻，用奥林匹斯之剑刺穿自己的身体，奎托斯血流满地。但是在游戏的最后，血迹一路留向大海，奎托斯却不见了。奎托斯自杀失败，剑拔出来后自己复原了。随后奎爷漂流到北欧隐居，结识了一个女子成立了家庭，最后有了儿子，也由此展开战神4的故事。
神秘的陌生人
故事开头，奎托斯砍下了一棵带有金色手印的树，将树扛回家用来火葬自己的妻子。奎托斯妻子的遗愿就是要让奎托斯用带有自己手印的树木进行火葬并将自己的骨灰从九界内最高的山上撒下，这也成为了战神4的主要剧情。在奎托斯准备带着儿子前往米德加尔特最高的山上时，遇到了一个陌生人，奎托斯和陌生人爆发了战斗最终将这个陌生人扭断了脖子丢下了山崖。
女巫芙蕾雅
离开居所踏上旅途。在路上遇到了矮人兄弟，通过矮人兄弟升级了武器利维坦之斧。后来奎托斯带着儿子打猎野猪时意外遇到了女巫芙蕾雅，而这个芙蕾雅也成为了之后故事的重要人物。芙蕾雅其实就是北欧神话里奥丁的妻子。奎托斯父子从女巫的房子出来后开船来到了湖中，奎托斯将斧子扔进了湖中引出了耶梦加得。
登上最高峰
父子子俩一路跋山涉水。踩雪踏怪后终于来到山顶不远了。但是此时通往顶部的过通被源源不断的黑色腐蚀迷雾阻挡着，之后去精灵国获取世界之光驱散黑色迷雾。历经磨难来到山顶，遇见到了故事开头发生战斗的神秘陌生人并得知他的身份。原来陌生人是巴德尔即北欧神话中的光明之神。在巴德尔离开后，见到了被奥丁捆住的巨人密米尔，密米尔告诉奎托斯父子最高的山其实在约顿海姆，即巨人国度。
开启投影门前往巨人国度
为了得知前往巨人国度的路，奎托斯决定帮助密米尔逃离禁锢。砍下密米尔的头后，来到芙蕾雅处将其复活。从密米尔与芙蕾雅的交谈中得知，芙蕾雅就是奥丁的前妻，曾经华纳神族的领袖。之后便是为了前往巨人国度做准备，途中遭遇了雷神索尔之子曼尼和摩迪，双方爆发战斗。结果造成奎托斯儿子阿特柔斯濒死，奎托斯只好带着混沌之刀前往亡者国度，拯救儿子。父子二人历经磨难终于来到前往巨人国度的投影门前，却遭遇了巴德尔。混战间通道被毁，阿特柔斯也被巴德尔带走。
前往巨人国度的另一条路
奎托斯追上巴德尔，二者在传送间厮打起来，结果被传送到了亡灵国度。在离开亡灵国度的路上又遇到了被幻像围困的巴德尔，此时奎托斯父子才了解到了巴德尔其实是芙蕾雅的儿子。之后在前往传送间时意外来到了奥丁的密室，并在此得知前往巨人国度的另一个办法。开启国度旅行需要密米尔的另一只眼睛，眼睛在巨蛇耶梦加得体内。于是，奎托斯父子便前往耶梦加得这里获取眼睛。
最终战斗
取得眼睛从蛇肚出来后，又遭遇了巴德尔，双方爆发了最后的战斗。混战中，巴德尔的老妈芙蕾雅也加入战斗。最终父子二人利用槲寄生打败了巴德尔，然而巴德尔并未死心执意要杀死母亲芙蕾雅 。原来由于母亲的祝福巴德尔获得了不死之身（槲寄生可破解），正是因为不死之身，巴德尔对―切事物都没有感觉所以他痛恨自己的母亲。这时一旁的阿特柔斯连忙叫住走远的父亲 ！最后奎托斯勒住了巴德尔的脖子杀了他。
故事的结局
奎托斯通过层层关卡开启国度旅行终于来到约顿海姆。约顿海姆的壁画记录了父子二人一路上的经历，从壁画上奎托斯得知妻子劳菲其实是巨人族的，也得知阿特柔斯被巨人族称为洛基的事实。然后父子二人登上最高峰并在这里洒下了骨灰。至此战神4的故事也基本结束了，在返回途中密米尔说芬布尔之冬开始了，当冬天结束时诸神黄昏就会开启了。
结尾彩蛋
奎托斯父子回到家，躺上床睡觉。一段时间后，突然狂风大作电闪雷鸣，一名带着雷电锤子的神秘人站在屋外，随后画面在奎托斯的质问声中戛然而止了。
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